Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA4CQ9C0C4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms