Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP1Q9C000 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP1Q9C000 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms