Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms