Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms