Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms