Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms