Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNG6Q9BXT2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNG6Q9BXT2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms