Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYCP2Q9BX26 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP2Q9BX26 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms