Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REPIN1Q9BWE0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms