Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms