Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MCMBPQ9BTE3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MCMBPQ9BTE3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms