Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.7 ms