Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms