Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LARP6Q9BRS8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LARP6Q9BRS8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms