Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LPIN3Q9BQK8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPIN3Q9BQK8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms