Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms