Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms