Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP8Q99708 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms