Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSF3RQ99062 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSF3RQ99062 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.9 ms