Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRAMP1Q96RY5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRAMP1Q96RY5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms