Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHF12Q96QT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms