Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMTK3Q96Q04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms