Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85AQ96PX6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85AQ96PX6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms