Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JSRP1Q96MG2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms