Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPNS2Q96L46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms