Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC41A2Q96JW4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC41A2Q96JW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms