Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BICD1Q96G01 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms