Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A4Q96EP9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC10A4Q96EP9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms