Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL53Q96EL3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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