Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPTQ96BT3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPTQ96BT3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms