Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1Q969G3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms