Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPS3Q969F9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms