Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms