Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RGP1Q92546 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms