Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DNAJA4Q8WW22 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms