Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC12Q8WUD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms