Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L4Q8WU68 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms