Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX3LQ8TDB6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms