Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC148Q8NFR7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC148Q8NFR7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms