Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC112Q8NEF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms