Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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CNNM3Q8NE01 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNNM3Q8NE01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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