Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms