Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP4Q8N3C7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CLIP4Q8N3C7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP4Q8N3C7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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