Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF444Q8N0Y2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF444Q8N0Y2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms