Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms