Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
KCNMB4Q86W47 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB4Q86W47 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms