Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTU1Q7Z7A3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms