Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT28Q7Z3Y7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT28Q7Z3Y7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT28Q7Z3Y7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms