Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms