Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BRINP3Q76B58 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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